En textos escaneados, Como se pueden hacer notas?

Buenas equipo! pues mi pregunta es si conoceis algun programa para una vez escaneado el texto quisiera hacer una nota, como subrayar, marcar algo si como con los apuntes de estudiar.
Muchas gracias y se agrecede vuestra sapiencia

Supongo que hablas de textos escaneados en pdf, no?
Yo uso iannotate, es una app de pago muy buena. Según la calidad del pdf tendrás más funciones, pero trabaja muy bien con textos escaneados.

En textos de pdf, yo utilizo GoodReader.

Una vez lo hayas escaneado y lo hayas pasado a PDF, lo mejor es que utilices estas dos app:

1) Goodreader: Para mi es el mejor gestor de archivos, puedes subrayar textos, añadir notas o incluso dibujar con tu dedo!!
2)iAnnotate PDF: fue la primera app para iPad que permitía el subrayado de textos PDF, pero para mi tiene una interfaz demasiado robusta!

Por precio-calidad, te recomiendo encarecidamente el GoodReader. Llevo utilizandolo sobre 3 semanas en la universidad y va muy bien. Solo le veo algún fallo en lo referente a la sincronización con dropbox (amenos es lo que he detectado yo) pero no es mas que un pequeño inconveniente a mi manera de ver ya que por lo demás es perfecto para lo que necesito